in significa «en», dentro de un sitio, generalmente cuando no hay movimiento:
He was in the room Estaba en la habitación
into significa «en», cuando hay movimiento:
He went into the room Entró en la habitación
Nota. A veces se usa in alternando con into, cuando no hay peligro de ambigüedad:
go in/into the room pasar a/entrar en la habitación
fall in/into the water caerse al agua
put in/into one’s pocket meter en el bolsillo